（一）擬訂全市創新驅動發展戰略以及科技發展規劃、計劃和政策，并組織實施和監督檢查。
（二）統籌推進全市科技創新體系建設和科技體制改革，指導科研機構改革發展和新型研發機構建設，推動企業科技創新能力建設，承擔推進科技與金融結合、科技軍民融合發展相關工作。會同有關部門健全科技創新激勵機制，推進重大科技決策咨詢制度建設。
（三）牽頭建立市級科技管理平臺和科技計劃項目資金協調、評估、監管機制，組織管理市級科技計劃（專項等）并監督實施。會同有關部門提出優化配置科技資源的政策措施建議，推動多元化科技投入體系建設。
（四）編制市級科技計劃并組織實施，統籌基礎研究、前瞻原創技術、關鍵核心技術、現代工程技術、產業變革技術等研發和創新，牽頭組織重大技術攻關和重大科技成果轉化產業化和應用示范。
（五）擬訂科學與工程研究、技術創新與成果轉化、基礎設施與條件保障等基地平臺布局規劃并組織實施，參與組織重大科技基礎設施建設。指導科技社會組織相關管理工作。推動科研條件保障建設和科技資源統籌開放共享。
（六）組織擬訂高新技術發展及產業化、科技促進農業農村和社會發展的規劃、政策和措施。組織開展重點領域技術發展需求分析，提出重大任務并監督實施。
（七）負責全市技術轉移體系建設，擬訂科技成果轉移轉化及產業化和促進產學研結合、科技知識產權創造的相關政策措施。指導科技服務業、技術市場和科技中介組織發展。
（八）統籌區域科技創新體系建設，指導區域創新發展、科技資源合理布局和協同創新能力建設。推動創新型縣市、創新型鄉鎮建設。
（九）負責高新技術產業開發區指導服務協調和管理工作，組織指導各類科技園區和創新創業載體建設。會同有關部門開展高新技術企業等的初審推薦和相關管理工作。
（十）負責科技監督評價體系建設和相關科技評估管理，指導科技評價機制改革，統籌科研誠信建設。組織實施全市創新調查。指導科技安全和科技保密相關工作。
（十一）會同有關部門擬訂科技人才隊伍建設規劃和政策，建立健全科技人才評價和激勵機制，組織實施科技人才計劃，推動高端科技創新人才隊伍建設。參與擬訂科學普及和科學傳播規劃、政策。
（十二）擬訂國際科技合作與交流的政策和措施，協調推進跨國（境）技術轉移工作，指導國際科技合作基地和外資研發機構建設。
（十三）負責全市引進國外智力和外國專家管理工作。擬訂引進外國專家規劃、計劃并組織實施。建立重點外國專家、團隊吸引集聚聯系服務機制。擬訂出國（境）培訓規劃、年度計劃并監督實施。負責外國人才、人員工作許可等事項。
（十四）負責社會力量設立科學技術獎管理工作。
（十五）認真履行部門安全生產、消防安全、生態文明建設的工作職責和責任。
（十六）擬訂昆山對臺科技合作與交流的政策措施，推進昆山深化兩岸產業合作試驗區建設。
（十七）完成市委、市政府交辦的其他任務。
（十八）職能轉變。圍繞貫徹實施創新驅動發展戰略，加強、優化、轉變政府科技管理和服務功能，完善科技創新制度和組織體系，加強宏觀管理和統籌協調，減少微觀管理和具體審批事項，加強事中事后監管和科研誠信建設。從研發管理向創新服務轉變，深入推進科技計劃管理改革，減少科技計劃項目重復、分散、封閉、低效和資源配置“碎片化”的現象。加強科技創新規劃布局和績效評價，建立健全以創新能力、質量、貢獻、績效為導向的科技評價體系和激勵政策。
